Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BC005561E9Q5E2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BC005561E9Q5E2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BC005561E9Q5E2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms