Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Abcc4E9Q236 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcc4E9Q236 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms