Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzd2E9Q1M1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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