Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms