Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms