Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fndc1E9Q043 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms