Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ryr1E9PZQ0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ryr1E9PZQ0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms