Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ift140E9PY46 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ift140E9PY46 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ift140E9PY46 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ift140E9PY46 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ift140E9PY46 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ift140E9PY46 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ift140E9PY46 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ift140E9PY46 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ift140E9PY46 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ift140E9PY46 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms