Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3002E9PW72 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3002E9PW72 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms