Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syde2E9PUP1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms