Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BC048679D3YXE9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms