Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc11B2RXC1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms