Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cfap58B2RW38 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cfap58B2RW38 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms