Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Uhrf1bp1B2KF50 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Uhrf1bp1B2KF50 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1B2KF50 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms