Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34b1B1AZQ8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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