Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scn7aB1AYL1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn7aB1AYL1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn7aB1AYL1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms