Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Grik3B1AS29 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms