Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CatsperbA2RTF1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatsperbA2RTF1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms