Protein–RNA interactions for Protein: A2AX52

Col6a4, Collagen alpha-4(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a4A2AX52 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms