Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klhl41A2AUC9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms