Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Pramef17A2ASJ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef17A2ASJ1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms