Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syndig1A2ANU3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syndig1A2ANU3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms