Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FocadA2AKG8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms