Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Frmpd1A2AKB4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Frmpd1A2AKB4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Frmpd1A2AKB4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Frmpd1A2AKB4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms