Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm11A2AGX3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm11A2AGX3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms