Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd4A2AFR3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmpd4A2AFR3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms