Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700023F06RikA2AB62 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700023F06RikA2AB62 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700023F06RikA2AB62 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700023F06RikA2AB62 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700023F06RikA2AB62 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
1700023F06RikA2AB62 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
1700023F06RikA2AB62 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700023F06RikA2AB62 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700023F06RikA2AB62 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700023F06RikA2AB62 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700023F06RikA2AB62 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700023F06RikA2AB62 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms