Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prdm16A2A935 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Prdm16A2A935 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms