Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-3A2A588 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-3A2A588 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms