Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam71e1A1L3C1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71e1A1L3C1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms