Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms