Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv21A0A0A6YX06 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Trbv21A0A0A6YX06 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv21A0A0A6YX06 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms