Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rabgef1Q9JM13 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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Rabgef1Q9JM13 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
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Rabgef1Q9JM13 AC139758.2-201ENSMUST00000228380 529 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 1700009N14Rik-201ENSMUST00000029955 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
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Rabgef1Q9JM13 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
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