Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms