Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26209-201ENSMUST00000103852 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm14682-201ENSMUST00000117977 524 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm11953-201ENSMUST00000122352 1003 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm5037-201ENSMUST00000205327 618 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir187-201ENSMUST00000083598 61 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1270-201ENSMUST00000099754 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26705-201ENSMUST00000180761 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Sycn-201ENSMUST00000119180 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm16077-201ENSMUST00000121915 655 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm17978-201ENSMUST00000195986 769 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp3-202ENSMUST00000220730 579 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 AC159312.1-201ENSMUST00000221508 856 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2a1d-201ENSMUST00000098486 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sft2d1Q5SSN7 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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