Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PrcdQ00LT2 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms