Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 AC124686.1-201ENSMUST00000225546 522 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PctpP53808 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Fam166b-202ENSMUST00000107928 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Olfr754-ps1-201ENSMUST00000173181 911 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm28401-202ENSMUST00000190769 550 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Med6-201ENSMUST00000002756 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PctpP53808 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PctpP53808 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms