Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TfamP40630 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
TfamP40630 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
TfamP40630 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
TfamP40630 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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TfamP40630 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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TfamP40630 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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TfamP40630 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TfamP40630 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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