Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Ighv1-9-201ENSMUST00000103498 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm11760-201ENSMUST00000122355 796 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Kcnab3os-201ENSMUST00000136196 566 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 BC021767-202ENSMUST00000136988 905 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm7577-201ENSMUST00000182543 982 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 2210420H20Rik-201ENSMUST00000188435 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Igkv12-42-201ENSMUST00000198769 327 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm43310-201ENSMUST00000198975 820 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Ceacam1-204ENSMUST00000205308 993 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm32834-202ENSMUST00000222417 655 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Psors1c2-201ENSMUST00000025273 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Raet1d-202ENSMUST00000182677 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms