Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
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Taf4bG5E8Z2 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Taf4bG5E8Z2 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Taf4bG5E8Z2 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Taf4bG5E8Z2 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Taf4bG5E8Z2 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Taf4bG5E8Z2 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms