Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc28-201ENSMUST00000032775 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm12163-201ENSMUST00000121597 389 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr721-ps1-201ENSMUST00000165291 975 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Rasgrp1-205ENSMUST00000173541 2283 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm27166-201ENSMUST00000184476 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ubqln3-201ENSMUST00000057254 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Numb-201ENSMUST00000021647 1815 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Atp6ap2-201ENSMUST00000033313 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 AC165260.6-201ENSMUST00000225447 1735 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Tmem181b-ps-202ENSMUST00000180035 2426 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Vnn1-201ENSMUST00000041416 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm13651-201ENSMUST00000119086 1110 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm12320-201ENSMUST00000127333 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2c37-201ENSMUST00000049178 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 4933402N03Rik-201ENSMUST00000070980 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Itgbl1-201ENSMUST00000049681 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Cenpq-201ENSMUST00000087114 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 4732419C18Rik-201ENSMUST00000181805 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Nip7-201ENSMUST00000034392 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Grhl3-201ENSMUST00000105855 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Gna14-201ENSMUST00000025602 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hdac5Q9Z2V6 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms