Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms