Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC122774.1-201ENSMUST00000227703 762 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Retnlb-201ENSMUST00000023328 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Med6-201ENSMUST00000002756 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 AC123665.5-201ENSMUST00000226648 1392 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf4Q9QZS2 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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