Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 U2af1l4-205ENSMUST00000163482 668 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Sdhd-201ENSMUST00000000175 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm20686-201ENSMUST00000175846 535 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm19402-201ENSMUST00000180297 801 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm26974-202ENSMUST00000183263 930 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Abracl-201ENSMUST00000020002 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm45436-201ENSMUST00000210729 469 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr977-ps1-201ENSMUST00000217438 943 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 AC118250.2-201ENSMUST00000228890 416 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm10036-201ENSMUST00000079733 537 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr555-201ENSMUST00000098220 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm37409-201ENSMUST00000195811 1626 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Msr1-201ENSMUST00000026021 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rabgef1Q9JM13 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC8.27□□□□□ -1.08
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Rabgef1Q9JM13 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Rabgef1Q9JM13 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Rabgef1Q9JM13 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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Rabgef1Q9JM13 Gm16541-201ENSMUST00000160992 614 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Rabgef1Q9JM13 Gm17158-201ENSMUST00000168150 493 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm6723-201ENSMUST00000180449 441 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26726-201ENSMUST00000181889 395 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm28478-201ENSMUST00000185802 183 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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