Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm32089-201ENSMUST00000221222 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ccdc97Q9DBT3 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc97Q9DBT3 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc97Q9DBT3 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc97Q9DBT3 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms