Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Nup155Q99P88 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Nup155Q99P88 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nup155Q99P88 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Nup155Q99P88 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Nup155Q99P88 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nup155Q99P88 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Nup155Q99P88 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nup155Q99P88 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nup155Q99P88 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nup155Q99P88 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms