Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Palb2-202ENSMUST00000098068 3750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Clcn7-201ENSMUST00000040729 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Phactr4-203ENSMUST00000102568 4614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Olfr6-202ENSMUST00000213552 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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