Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Usp54Q8BL06 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp54Q8BL06 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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