Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Shq1Q7TMX5 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Shq1Q7TMX5 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Shq1Q7TMX5 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms