Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 AC142114.1-201ENSMUST00000227724 328 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 AC119987.1-201ENSMUST00000212316 848 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm5407-201ENSMUST00000080694 747 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm7275-201ENSMUST00000088296 744 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms